Fernando Pacheco Flores začal svoji mládežnickou fotbalovou kariéru v klubu Deportivo Alavés kde si jej pro jeho talent vyhlédl slavný Real Madrid v jehož barvách strávil celý juniorský věk. Jak už to tak ve velkých klubech bývá v prvním mužstvu šanci nedostal a nepomohlo mu ani to, že je to španělský mladežnický reprezentant. V roce 2015 se tedy vrátil domů a chytá za Deportivo Alavés.
